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Olá, respondendo a pergunta amigo, jtag no caso de box para celulares, é uma interface em que a box faz ligação e comunicação direta na memoria principal do aparelho, normalmente, através de pequenos fios que devem ser soldados na placa do celular em questão, (normalmente são 4 ou mais fios, sendo os 4 básicos: GND, Rx, Tx, Clk) e a box tentará fazer a comunicação direta eliminando intermediários na placa do celular, fazendo reparos através de uma regravação de arquivos de boot, loader, etc... A Medusa PRO da Octoplus é uma das melhores nesse quesito na minha opinião. Já Emmc é o nome dado a esse chip de memoria interna dos celulares, que o Jtag faz essa comunicação e reparo. Espero ter conseguido explicar de forma simples e ter ajudado.